醫院現有城中、陽湖、金東方三個院區，按照“做強陽湖，做精城中，做優金東方”的行動綱要，堅持院區和分院同質化管理，差異化發展。醫院已與近20家醫療機構等形成了區域型、緊密型、專科共建型和對口幫扶型等多種形式的醫療聯合體，并于2017年8月加入吳階平醫學基金會區域醫療協作體，有力推進分級診療和優質醫療資源下沉。

目前住院床位2200張，年門急診總量221.53萬人次，出院病人9.4萬人次，手術4.4萬例。在崗職工2826人，其中高級職稱527人，博士、碩士學位651人。作為“國家級博士后科研工作站”，現有博士生培養點5個，碩士生培養點17個，博士生、碩士生導師89人。擁有江蘇省青年醫學人才10名，江蘇省六大高峰人才4名，江蘇省333高層次培養對象14名，常州市領軍人才10名，拔尖人才10名。

醫院科室設置齊全，技術力量雄厚。設有臨床和醫技科室57個，其中江蘇省醫學重點學科（共建）1個，江蘇省醫學創新團隊（共建）1個，省級臨床重點專科11個（含建設單位3個），南京醫科大學醫學重點學科1個，南醫大校級重點實驗室1 個，市級醫學重點學科7個（含培育單位2個），市級臨床重點專科30個。普外科、骨科、內分泌科、婦科、胸外科、心內科、呼吸內科、腫瘤科、放療科的數十項技術在國內、省、市居領先或先進水平。近年來，醫院組建了胃腸病中心、腫瘤中心、放射治療中心、消化道腫瘤多學科診治中心、代謝病診治中心、無痛內鏡中心、骨質疏松診治中心、心肺診療中心等多學科綜合診療中心，與上海中山醫院、瑞金醫院多學科診療服務中心結為協作醫院；成為國家高級卒中中心，中國胸痛中心，建有創傷中心、房顫中心，開啟一體化急救模式，打造區域急救中心；開設了糖尿病護理門診、慢性傷口門診、造口門診、PICC門診、影像介入與咨詢門診、助產士門診、更年期保健醫護聯合門診等特色門診。

醫院堅持科教興院，成立黎介壽院士工作站、中國工程院孫穎浩院士常州工作站、中國工程院郎景和院士常州工作站，被列為國家衛計委腔鏡培訓基地、國家級住院醫師規范化培訓基地、國家衛計委臨床藥師培訓基地和國家藥物臨床試驗機構，2017年I期臨床試驗中心投入使用。成為徐州醫科大學、蘇州大學、南通大學、江蘇大學、蚌埠醫學院等醫學高等院校教學醫院，并與常州大學合辦護理學院，填補了常州本科護理高等教育空白。近五年來，各級科研項目立項232項，其中獲國家自然科學基金22項，江蘇省社會發展項目4項，江蘇省自然科學基金6項，獲江蘇省衛生廳新技術引進獎13項，市科技進步獎18項，發表中華級論文145篇，SCI收錄雜志論文376篇。

醫院重視“信息化、智能化、人性化”建設，牢牢把握“互聯網+”技術融合，啟用全院自助服務體系、醫院資源管理系統（HRP）、質量管控系統（HQS）、大數據平臺和軌道小車物流傳輸系統等智能化應用系統，在提升醫院整體服務水平的基礎上，有效促進患者就醫更便捷與醫院精細化管理。

八十年來，常州市第二人民醫院始終堅持“以病人為中心”的服務宗旨，秉承“愛院、愛崗、愛人、敬業、勤業、精業”的醫院精神，實施科學管理、打造文化品牌。2017年建成吳階平紀念館，先后獲得“全國精神文明建設工作先進單位”、“國家衛計委改善醫療服務示范醫院”、“全國巾幗文明崗”、“全國青年文明號”、“江蘇省文明單位”、“江蘇省五一勞動獎狀”、首批“江蘇省文化建設示范點”、“常州市文明標兵單位”、“常州市科普教育基地”等稱號，在香港艾力彼醫院管理研究中心全國地級城市醫院競爭力排名中連續三年入圍百強醫院。